一文看懂基因檢測領(lǐng)域十九大最新進(jìn)展

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圖片來源:123RF


1、FH基金會宣布關(guān)于家族性高膽固醇血癥(FH)基因檢測的共識聲明


家族性高膽固醇血癥(FH)基金會宣布,關(guān)于診斷家族性高膽固醇血癥(FH)的重要共識聲明,該聲明建議進(jìn)行基因檢測,以診斷患有FH的人及其親屬。對有風(fēng)險的個體進(jìn)行基因檢測有望加速確診,以確保早期治療。全世界有超過3000萬人患有FH,其中90%目前未被確診。


共識聲明建議為有高膽固醇或早期心臟病發(fā)作的陽性家族史的患者提供FH相關(guān)基因檢測,這些個體具有明確或可能的FH。大多數(shù)FH病例存在三種變異,它們可增加患冠狀動脈疾病(CAD)的風(fēng)險。這些變異的位點在低密度脂蛋白受體(LDLR),載脂蛋白B( APOB)或Proprotein Convertase枯草桿菌蛋白酶/Kexin 9型(PCSK9)。


2、打造新型測序技術(shù),Omniome獲中國投資者領(lǐng)投的6000萬美元


近日,一家專注新型DNA測序技術(shù)的圣地亞哥公司籌集了6000萬美元資金,多家中國投資者參與投資。該公司名為Omniome ,由Illumina前員工于2013年首創(chuàng),該公司的技術(shù)可以低成本提供高度準(zhǔn)確和快速的測序結(jié)果。此次新的B輪融資由新投資者Decheng Capital(上海)和Hillhouse Capital(北京)領(lǐng)投,Lam Research Capital(美國)和Nan Fung Life Sciences(香港)跟投。該公司的技術(shù)被稱為“結(jié)合測序”(SBB),可以通過利用聚合酶的自然匹配能力“提高核苷酸和DNA匹配的精確度?!边@減少了運行時間并增加了每次運行的樣品數(shù)量。


3、Chronix在AACC上展示腎移植液體活檢研究結(jié)果,近期將在美國推出產(chǎn)品


Chronix Biomedical是一家新型血液分子診斷開發(fā)公司,近日在美國臨床化學(xué)協(xié)會(AACC)年會上口頭匯報了其Therasure移植監(jiān)測儀在監(jiān)測器官移植排斥早期癥狀的前瞻性臨床研究結(jié)果。Therasure移植監(jiān)測儀通過測量血液中移植物來源的無細(xì)胞DNA(GcfDNA),作為急性排斥和器官健康早期征兆的生物標(biāo)志物,可以避免患者進(jìn)行不必要的活檢。研究數(shù)據(jù)顯示,在檢測所有主要實體器官移植物的早期移植排斥方面,Therasure比其他相關(guān)測試具有更廣泛的適用性。該公司目前正在歐洲國家推出其Therasure產(chǎn)品系列,并將在未來12個月內(nèi)進(jìn)入美國市場。


4、QIAGEN與日本最大的臨床實驗室公司SRL合作,加速推出伴隨診斷


QIAGEN宣布與日本最大的臨床檢測實驗室公司SRL公司合作,為新藥批準(zhǔn)的伴隨診斷做準(zhǔn)備。此次臨床實驗室研究服務(wù)的非獨家主協(xié)作協(xié)議將使得QIAGEN的配套診斷工作流程在日本藥品和醫(yī)療器械局(PMDA)批準(zhǔn)藥物和測試后能夠快速實施。QIAGEN與醫(yī)藥合作伙伴共同開發(fā)的幾項測試預(yù)計將在未來幾年進(jìn)入日本注冊。QIAGEN與SRL的Day-One實驗室協(xié)議將涵蓋一系列QIAGEN伴隨診斷,包括用于個體化醫(yī)療保健的實時聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)和下一代測序(NGS)解決方案。最初的項目涉及QIAGEN伴隨診斷,配合正在日本開發(fā)的用于治療實體瘤和白血病的新藥。


5、Personalis獲得紐約州衛(wèi)生部批準(zhǔn),在癌癥免疫治療臨床試驗中使用其ACE ImmunoID?平臺


領(lǐng)先的免疫基因組測序和分析提供商Personalis宣布,它已獲得紐約衛(wèi)生部批準(zhǔn)使用ACE ImmunoID——個體化癌癥疫苗和IO生物標(biāo)志物發(fā)現(xiàn)的下一代測序平臺——用于癌癥免疫治療臨床試驗。Personalis臨床實驗室許可證已被授予腫瘤學(xué)——分子和細(xì)胞腫瘤標(biāo)記物類別。


ACE ImmunoID基于Personalis專有的ACE(精確度和內(nèi)容增強)技術(shù),結(jié)合了整個外顯子組和轉(zhuǎn)錄組測序,覆蓋了大約20,000個基因,并增加了超過8,000個基因的擴增覆蓋率。因此,ACE ImmunoID提供比其他商業(yè)上可用的外顯子組更均勻的測序覆蓋度,用于全面的變異體捕獲(SNV,插入缺失和融合),以及用于個體化癌癥疫苗開發(fā)的新抗原檢測。

本文來源:藥明康德

6、投資3億美元,GSK與23andMe合作研發(fā)新藥


將利知名醫(yī)藥企業(yè)葛蘭素史克(GSK)與消費者基因檢測先驅(qū)公司23andMe宣布達(dá)成4年獨家合作,用人類遺傳學(xué)信息研發(fā)創(chuàng)新療法。GSK同時將對23andMe進(jìn)行3億美元的股權(quán)投資。據(jù)了解,兩家公司的新藥研發(fā)合作將立即啟動,而GSK的一款LRRK2抑制劑項目將是最早開啟的計劃之一。目前,這款新藥正位于臨床前的開發(fā)中,有治療帕金森病的潛力。而23andMe對LRRK2變異位點的檢測,有望加速這一臨床項目的開發(fā)。


23andMe自成立至今,已經(jīng)擁有了超過500萬名用戶,建立起了世界上規(guī)模最大的遺傳學(xué)/表型數(shù)據(jù)庫之一。本次合作將結(jié)合23andMe大規(guī)模的遺傳學(xué)資源和先進(jìn)的數(shù)據(jù)科學(xué)技術(shù),以及GSK在科學(xué)和醫(yī)學(xué)上的專精,強強聯(lián)手,尋找關(guān)于創(chuàng)新藥物靶點的洞見,帶來創(chuàng)新療法,滿足廣大未竟的醫(yī)療需求。本次合作主要涵蓋三個方面:1)改善新藥靶點的選擇,帶來更安全、更精準(zhǔn)的新藥;2)助力對患者亞組的鑒定與選擇;3)更有效地招募臨床試驗患者。通過尋找到帶有特定遺傳學(xué)特征的患者亞組,加速他們進(jìn)入臨床試驗的進(jìn)程,縮短臨床開發(fā)周期。


7. 美國NCCN發(fā)布罕見妊娠癌癥的首個指南


2018年8月9日,美國國家綜合癌癥網(wǎng)絡(luò)(NCCN)針對一組影響孕婦的罕見癌癥發(fā)布了新的治療指南。妊娠滋養(yǎng)細(xì)胞腫瘤(GTN)也稱為妊娠滋養(yǎng)細(xì)胞疾?。℅TD),在妊娠期間通常發(fā)生在形成胎盤的細(xì)胞上。它在美國的發(fā)生率是每1000次懷孕中大約有一次,但在許多亞洲和非洲國家更為常見。


針對GTN的NCCN指南詳細(xì)介紹了幾種疾病類型的治療方法。對于葡萄胎妊娠,手術(shù)是首選和唯一選擇。低風(fēng)險GTN主要用單藥化療治療,但持續(xù)性疾病可能需要額外的化療或手術(shù)治療。對于高風(fēng)險的GTN,通常涉及多藥物化療,可能的腦轉(zhuǎn)移放射治療。手術(shù)可用于化療耐藥性疾病。如這些標(biāo)準(zhǔn)化指南中所述,如果患者得到適當(dāng)?shù)墓芾?,不僅會取得好的長期療效,而且大多數(shù)患者的生育能力也得以保留。


8. OmniTier聯(lián)合梅奧診所應(yīng)用新測序技術(shù),最大深度可達(dá)800×


OmniTier在與梅奧診所個體化醫(yī)療中心的研究人員進(jìn)行的一項聯(lián)合研究中宣布使用"de novoglobal assembly"技術(shù)進(jìn)行人類DNA突變檢測,該技術(shù)具有性能和成本的突破。使用經(jīng)過充分表征的NA12878短讀長序列基因組數(shù)據(jù)集,CompStor?計算集群在不到兩小時的時間內(nèi)完成了50x基因組的variant-caller-ready組裝。該解決方案可擴展至800x序列覆蓋范圍,這在以前被認(rèn)為是在de novo技術(shù)中不能可靠地識別新突變和不常見突變的數(shù)據(jù)集容量范圍。該聯(lián)合研究還表明,de novo分析不再需要超級計算資源,而是可以在基于標(biāo)準(zhǔn)的低成本服務(wù)器的特定生物信息應(yīng)用平臺上完成,為高通量測序的廣泛應(yīng)用打開了大門。


9. Quadrant與Admera Health合作,開展自閉癥基因檢測


新興生命科學(xué)公司Quadrant Biosciences宣布與總部位于新澤西州的分子診斷公司Admera Health建立戰(zhàn)略合作伙伴關(guān)系。Quadrant Biosciences開發(fā)了先進(jìn)的表觀遺傳學(xué)工具,用于診斷神經(jīng)系統(tǒng)疾病,包括自閉癥譜系障礙,帕金森病,ADD/ADHD和腦震蕩。Admera Health專注于高級分子診斷和個體化醫(yī)療領(lǐng)域。根據(jù)協(xié)議條款,Admera Health將在其CLIA認(rèn)證機構(gòu)執(zhí)行Quadrant Biosciences實驗室開發(fā)的自閉癥譜系障礙檢測。


10. 美國基因檢測提供商Orig3n與眾安保險達(dá)成戰(zhàn)略合作


美國生物技術(shù)公司Orig3n宣布已與眾安在線財產(chǎn)保險股份有限公司(“眾安保險”)簽訂合作協(xié)議。根據(jù)協(xié)議,眾安保險將采用Orig3n公司提供的基因檢測技術(shù)擴大其在線健康解決方案。Orig3n公司是美國市場活躍、且擁有全面消費級產(chǎn)品線的基因檢測提供商;眾安是中國最大的互聯(lián)網(wǎng)保險公司之一。雙方將在上海合作共建實驗室,專注于醫(yī)療技術(shù)的應(yīng)用和創(chuàng)新,旨在為中國消費者提供個體化的醫(yī)療保健解決方案。


11. 鼎航醫(yī)藥與HTG Molecular Diagnostics合作開發(fā)腫瘤免疫療法伴隨診斷


中美兩地運營的創(chuàng)新生物醫(yī)藥公司鼎航醫(yī)藥(Oncologie)與美國 HTG Molecular Diagnostics 宣布已簽署生物標(biāo)志物開發(fā)合作協(xié)議,將共同為鼎航醫(yī)藥的腫瘤免疫治療管線開發(fā)獨特的伴隨診斷產(chǎn)品,以提高免疫腫瘤藥物的治療效果和特定人群的長期生存率。具體財務(wù)細(xì)節(jié)未披露。HTG是美國一家精準(zhǔn)醫(yī)療診斷公司,專注于二代測序(NGS)平臺生物分子特征鑒定技術(shù),通過其自主知識產(chǎn)權(quán)的 HTG EdgeSeq 自動化技術(shù)平臺,對痕量液體或固體生物樣本實現(xiàn)復(fù)雜的分子特征譜鑒定。該公司有很多客戶使用這項生物標(biāo)記物鑒定技術(shù)開發(fā)新的精準(zhǔn)醫(yī)療臨床方案,從而為患者帶來新的治療手段。


12.  Macrogen:韓國兩家臨床實驗室獲得CAP認(rèn)證


韓國精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)生物技術(shù)公司Macrogen宣布,它位于其首爾總部和盆唐的兩個二代測序(NGS)臨床實驗室和精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)中心獲得了美國病理學(xué)(CAP)認(rèn)證。Macrogen現(xiàn)在擁有三個通過國際認(rèn)證的全球NGS臨床實驗室,包括2017年10月獲得CAP認(rèn)證的Macrogen USA。CAP是國際公認(rèn)的實驗室認(rèn)證計劃,也是同類中規(guī)模最大的認(rèn)證項目,有8000多個實驗室參與。Macrogen得到CAP認(rèn)可進(jìn)行NGS基因組分析,有資格提供符合全球標(biāo)準(zhǔn)的基因檢測服務(wù),包括非侵入性產(chǎn)前檢查(NIPT),癌癥panel,BRCA1/2 panel,遺傳性癌癥panel和全外顯子組測序


13. MIT與哈佛大學(xué)“多基因風(fēng)險評分”技術(shù)可預(yù)測5種嚴(yán)重疾病的風(fēng)險


麻省理工學(xué)院和哈佛大學(xué)Broad研究所的科學(xué)家表示,他們已經(jīng)開發(fā)出一種基因組篩查工具,它可以預(yù)測乳腺癌,2型糖尿病,冠狀動脈疾病,心房顫動和炎癥性腸病的風(fēng)險。識別這些高風(fēng)險人群,有利于提供個體化的預(yù)防性護理。Broad團隊與麻省總醫(yī)院(MGH)和哈佛醫(yī)學(xué)院的研究人員合作,開發(fā)了一種基于已有的五種病癥和基因突變的數(shù)據(jù)來評估疾病風(fēng)險的方法。對于每種疾病,他們使用算法將所有相關(guān)的基因突變組合成一個單一風(fēng)險評分。然后,他們從英國生物銀行存儲的超過400,000人中獲取基因組數(shù)據(jù),并使用這些算法預(yù)測每個人患這些疾病的風(fēng)險。這項名為“多基因風(fēng)險評分”的技術(shù)發(fā)現(xiàn),在英國生物銀行庫中,8%的人的冠狀動脈疾病風(fēng)險比其他人高三倍。它還發(fā)現(xiàn),生物庫中1.5%的人患乳腺癌的風(fēng)險增加了三倍。該研究成果近期發(fā)表在《Nature Genetics》上。


14. GeneNews和LifeX?合作,推進(jìn)“液體活檢”早期癌癥診斷技術(shù)臨床應(yīng)用


8月15日,液體活檢領(lǐng)域的創(chuàng)新公司GeneNews Limited宣布與總部位于匹茲堡的LifeX?建立合作伙伴關(guān)系。雙方將合作推進(jìn)多種專有的早期癌癥診斷醫(yī)療應(yīng)用,以提高患者對癌癥篩查的依從性,并彌補當(dāng)前癌癥篩查中的診斷差距。GeneNews已經(jīng)在數(shù)千名患者中測試并證明,使用簡單的液體活檢可以在早期檢測癌癥。這些測試是Aristotle?平臺的一部分,該平臺基于GeneNew專有的mRNA Sentinel Principle技術(shù),可為多種疾病生成高靈敏度的多基因檢測測試。GeneNews目前正在開發(fā)一種在單個血液樣本中監(jiān)測10種癌癥的基因檢測測試。


15. Natera和Fox Chase癌癥中心合作,研究液體活檢監(jiān)測腎癌復(fù)發(fā)


近日,無細(xì)胞DNA(cfDNA)檢測領(lǐng)域的全球領(lǐng)先公司Natera與美國著名的Fox Chase癌癥中心達(dá)成合作,評估該公司的循環(huán)腫瘤DNA(ctDNA)檢測產(chǎn)品Signatera?在監(jiān)測腎癌復(fù)發(fā)方面的效果。該研究將分析從49名被診斷患有腎癌的患者中收集和存儲的生物標(biāo)本——包括癌癥復(fù)發(fā)組和3年或更長時間后未復(fù)發(fā)組。該研究將評估Natera基于新一代測序技術(shù)(NGS)的Signatera產(chǎn)品是否可用于區(qū)分復(fù)發(fā)性和非復(fù)發(fā)性腎癌病例。目前在腎癌中ctDNA研究數(shù)據(jù)很少,現(xiàn)有方法在敏感性和特異性方面存在局限性。本研究將探索一種新的診斷腎癌復(fù)發(fā)和監(jiān)測治療反應(yīng)的方法。通過使用Signatera分析確定腎癌遺傳特征與預(yù)后(包括復(fù)發(fā))之間的關(guān)系,有望更早發(fā)現(xiàn)癌癥復(fù)發(fā),協(xié)助治療決策,確定治療效果以及評估干預(yù)需求,有望改善患者護理。


16. Seq2Know推出高膽固醇基因測試


近日,消費者基因檢測服務(wù)公司Seq2Know發(fā)布了一款家族性高膽固醇血癥(FH)檢測產(chǎn)品。該測試包括導(dǎo)致FH的四個重要基因的測序(LDLR,APOB,PCSK9,LDLRAP1)。FH是一種遺傳性的高膽固醇疾病,它會增加心臟病和中風(fēng)的患病風(fēng)險,而這兩種疾病分別是美國第一和第五大死亡原因。大約六分之一的成年人患有高膽固醇。雖然有超過3000萬人可能患有FH,但許多人并未意識到他們的風(fēng)險。FH基金會(FH Foundations)關(guān)于FH基因檢測的共識聲明認(rèn)為,基因檢測作為診斷方式,可以幫助預(yù)防與FH相關(guān)的心血管疾病?;驒z測對于持續(xù)高膽固醇,早期心臟病發(fā)作或有高膽固醇或早發(fā)性心臟病家族史的患者尤為重要。


17. IncellDx推出液體活檢產(chǎn)品——PD-L1 CTC檢測試劑盒


IncellDx是一家行業(yè)領(lǐng)先的單細(xì)胞癌癥診斷公司,近日該公司推出了一套完整的預(yù)優(yōu)化試劑盒,用于鑒定、計數(shù)和量化循環(huán)腫瘤細(xì)胞(CTC)上重要的腫瘤治療靶點PD-L1。作為該公司推出的第一款用于細(xì)胞液體活檢的新型試劑產(chǎn)品,BioINK?可在單細(xì)胞中以高靈敏度和高特異性,準(zhǔn)確檢測蛋白質(zhì)或mRNA表達(dá)量。該公司表示,在個體細(xì)胞水平識別和鑒定腫瘤細(xì)胞的能力將有助于實現(xiàn)癌癥的早期檢測和治療。


18. “IDH突變在腦腫瘤中的研究應(yīng)用”綜述發(fā)表于《Cancer Cell》


最近,一篇關(guān)于“IDH突變在癌癥中的生物學(xué)作用和治療潛力”的綜述文章發(fā)表于權(quán)威國際學(xué)術(shù)期刊《Cancer Cell》。該論文由杜克大學(xué)(Duke University)客座教授,泛生子(Genetron Health)聯(lián)合創(chuàng)始人兼首席科學(xué)家閻海博士和普林斯頓Robert Tisch腦腫瘤中心共同撰寫。該論文詳細(xì)分析了IDH抑制劑治療膠質(zhì)瘤和急性髓性白血?。ˋML)患者的臨床前和臨床研究,及其他可能的替代療法和免疫療法治療攜帶IDH1 / 2突變的腫瘤患者的研究。通過大量臨床前和臨床證據(jù)證明,IDH突變治療策略的開發(fā)和驗證非常重要,并將為患者提供未來的治療益處。由泛生子研究開發(fā)的IDH1/TERT基因突變檢測試劑盒已于2017年12月獲得CFDA批準(zhǔn)。它適用于膠質(zhì)瘤患者腫瘤組織中IDH1/R132H突變的臨床檢測,可為膠質(zhì)瘤的病理分類提供重要參考。


19. 賽默飛與桐樹生物合作,加快腫瘤基因檢測產(chǎn)品開發(fā)


8月10日,科學(xué)服務(wù)領(lǐng)域的世界領(lǐng)導(dǎo)者賽默飛世爾科技(Thermo Fisher Scientific)公司與上海桐樹生物科技有限公司宣布正式達(dá)成戰(zhàn)略合作。雙方將基于賽默飛公司的ABI&Ion Torrent平臺在腫瘤體外診斷領(lǐng)域展開深入合作,致力于腫瘤伴隨診斷產(chǎn)品的研發(fā),加快腫瘤基因檢測服務(wù)在中國臨床腫瘤市場的落地執(zhí)行,從而更好地惠及全中國的腫瘤患者。桐樹生物將基于賽默飛公司的ABI&Ion Torrent平臺進(jìn)行腫瘤伴隨診斷產(chǎn)品的開發(fā),賽默飛也將相應(yīng)地成立對接桐樹生物研發(fā)部門的技術(shù)團隊,助力其產(chǎn)品研發(fā)。賽默飛新推出的Ion Torrent Oncomine Lung cfTNA(cell-free Total Nucleic Acid)Research Assays是高靈敏度、多生物標(biāo)志物的新一代測序檢測方法。它可以檢測血液中游離的DNA和RNA,能為客戶提供簡單、穩(wěn)定、可靠的基于多重PCR的文庫構(gòu)建試劑。涵蓋與肺癌相關(guān)的標(biāo)記物包括ALK、RETROS1融合突變、拷貝數(shù)變異、MET基因14外顯子跳躍缺失,以及其它SNV和Indels。它能夠精確檢出低頻突變,cfTNA檢測下限低至0.1%。