2020，一場突如其來的疫情，讓整個人類世界再次意識到了防控體系建設的重要性。防大于治，這一點對于長期威脅人類健康的癌癥而言，同樣適用。為此，9月9日-9月29日，華大智造攜手丁香園，聯(lián)合安可濟生物、裕策生物、拓普基因、海普洛斯、圣庭生物等腫瘤基因檢測公司，共同在線上舉辦了2020高通量測序腫瘤專題研討會。
本次線上會議跨時20天，共邀請了37位專家，組織了14場精彩報告和4場圓桌討論，針對BRCA、早篩、免疫與生信算法、TMB和腫瘤大Panel、腫瘤原發(fā)灶不明癌等6大問題，對腫瘤基因檢測產(chǎn)品的本土化發(fā)展、臨床路徑以及產(chǎn)業(yè)化道路進行了探討。
面對突發(fā)疫情，將精準檢測與診斷提到與臨床搶救同等重要位置，為疑似病例檢測、高危人群排查提供精準的科學判斷，使得疫情在全國范圍內(nèi)得到了及時、有效的控制。華大智造COO蔣慧研究員表示，這離不開我國在疫情期間核酸檢測能力的大幅提升，也離不開本土化的自動化核酸檢測設備和解決方案的快速到位。圣庭生物聯(lián)合創(chuàng)始人谷紅倉教授認為，與核酸檢測能力建設相比，在疫情時代，腫瘤基因檢測的自動化解決方案也很重要。這是因為，大多數(shù)的腫瘤患者都很難接受因疫情或突發(fā)事件而導致停藥的風險。海普洛斯創(chuàng)始人兼CEO許明炎博士則指出，這次疫情暴露了全球醫(yī)療體系的現(xiàn)存短板。在全國范圍內(nèi)的腫瘤基因檢測能力和核酸檢測能力，都存在著一定的區(qū)域性差異，亟需加強整個防控體系的建設。安可濟生物董事長應康博士表示，中國企業(yè)的責任與擔當，以及在這次疫情中的積極響應，為疫情防控做出了重要貢獻。同樣的道理，面向腫瘤基因檢測的儀器設備和試劑耗材也不能過度依賴海外市場，這樣才能在特殊情況下，召之即來，來之能戰(zhàn)，戰(zhàn)之能勝。從這一點來看，自主可控的國產(chǎn)測序平臺，已成為越來越多腫瘤基因檢測企業(yè)的首選平臺。乳腺癌是女性常見的惡性腫瘤之一，發(fā)病率位居女性惡性腫瘤的首位。中山大學附屬第一醫(yī)院甲狀腺乳腺外科邵楠教授指出，基于乳腺癌全面基因組測序的現(xiàn)狀，選擇準確可靠的高通量測序平臺繪制全面的分子信息是實現(xiàn)乳腺癌精準治療的前提。而如今，國產(chǎn)測序平臺已經(jīng)走在行業(yè)前列，成為準確可靠的代名詞。中國醫(yī)學科學院腫瘤醫(yī)院乳腺外科齊立強教授表示，Oncotype Dx已通過大量的臨床試驗證明其在乳腺癌預后復發(fā)風險預測和化療獲益方面的作用，已被寫入多個臨床指南。拓普基因一直致力于乳腺癌診療領域，基于中國族群開發(fā)的評估模型目前正在開展多項臨床試驗，期待未來能夠讓更多中國患者精準獲益。河北醫(yī)科大學第四醫(yī)院腫瘤內(nèi)科史健教授認為，越來越多的腫瘤基因檢測的基礎數(shù)據(jù)與臨床證據(jù)顯示，PARP抑制劑不僅對于BRCA突變?nèi)巳河酗@著臨床獲益，對于更大范圍的HRD/HRR人群的也存在臨床獲益。拓普基因研發(fā)副總裁施玉健博士總結(jié)道，面向女性腫瘤精準治療，拓普基因整合基于DNBSEQ平臺和已發(fā)表中國人群的BRCA研究數(shù)據(jù)，在 2020 年 7 月上線了中文版 BRCA 基因解讀數(shù)據(jù)庫——EasyBRCA，希望能為女性腫瘤患者提供更多助力。問題3：本土化的腫瘤基因檢測產(chǎn)品，路在何方？
早發(fā)現(xiàn)、早治療，在手術(shù)可以根治的時候，甚至在癌前病變發(fā)生之際就予以干預，被公認為腫瘤防控的最佳措施。利用高通量測序技術(shù)，通過腫瘤基因檢測進行早篩和風險評估，促進了腫瘤防控體系的完善。中國非公立醫(yī)療機構(gòu)協(xié)會病理學?？莆瘑T會主任委員朱明華教授表示，隨著人工智能的發(fā)展，對健康人群和腫瘤患者的測序數(shù)據(jù)進行機器學習/深度學習，能夠為腫瘤的早期篩查和診斷提供更準確的判斷依據(jù)。上海市胸科醫(yī)院檢驗科主任婁加陶教授認為，與傳統(tǒng)的腫瘤標記物相比，基于高通量測序技術(shù)的腫瘤液體活檢技術(shù)的敏感性更優(yōu)，但其臨床應用要做到規(guī)范先行，準確先行才能行穩(wěn)致遠。至于如何更加高效識別高危人群，提高其依從性，同時彌補高危人群中早期肝癌篩查技術(shù)與方法的缺陷與不足，海軍軍醫(yī)大學第三附屬醫(yī)院肝膽內(nèi)科主任胡和平教授指出，高通量測序技術(shù)帶來了更多可能。利用DNBSEQ測序平臺，浙江大學醫(yī)學院附屬婦產(chǎn)科醫(yī)院副院長程曉東教授目前正在與安可濟生物合作開展卵巢癌早診早篩的研發(fā)項目。他期待在形成有效的檢測試劑盒并進行院內(nèi)應用后，聯(lián)合申報IVD，使得該試劑盒能推廣應用到全國范圍內(nèi)，讓更多的腫瘤患者受益。安可濟控股有限公司創(chuàng)始人應康博士則表示，腫瘤早診早篩技術(shù)性能和產(chǎn)品性能需要通過大規(guī)模臨床研究加以證明，這是耗資巨大的工程，需要謹慎對待。沒有高性能的檢測技術(shù)和生物信息分析能力，再多的樣本也找不出有效的客觀規(guī)律。由此應康博士呼吁業(yè)內(nèi)同行加強合作，攜手與國際同行競爭并爭取勝利。問題4：臨床醫(yī)生需要什么樣的腫瘤Panel設計與生信算法開發(fā)？
如何提高腫瘤變異檢測的準確率？這一點與腫瘤Panel的產(chǎn)品設計以及生信算法開發(fā)密切相關。深圳市人民醫(yī)院許瑞蓮教授指出，Panel的設計涉及大小涵蓋的基因、可檢測的變異類型等細節(jié)，精準的panel設計讓檢測結(jié)果更精準，更有臨床指導意義。深圳市龍華區(qū)人民醫(yī)院何秋山教授表示，利用更精準的生信算法分析出超低頻的基因變異帶給給患者獲益的希望。廣州醫(yī)科大學附屬第三醫(yī)院魏立平教授則強調(diào)，腫瘤基因檢測背后的技術(shù)復雜性超出了想象，臨床上需要更多透徹的了解各個關鍵環(huán)節(jié)。深圳市人民醫(yī)院何婉教授認為，臨床醫(yī)生需要全面的檢測信息來決策治療方案，需要涵蓋最全面的免疫治療相關標志物的相關產(chǎn)品。海普洛斯生信研發(fā)副總監(jiān)周衍慶博士表示，利用DNBSEQ測序平臺進行高深度測序后得到的腫瘤測序數(shù)據(jù)質(zhì)量非常好，加之海普洛斯開發(fā)的生信算法，可以準確識別變異基因，包括極低頻的變異位點。問題5：如何看待腫瘤大Panel的IVD注冊發(fā)展前景和臨床路徑？
在今年上半年，基于高通量測序技術(shù)的多款液體活檢伴隨診斷大Panel產(chǎn)品獲批FDA。對此，中國醫(yī)學科學院腫瘤醫(yī)院石遠凱教授表示，大Panel檢測有助于免疫綜合評估，為TMB檢測提供了更多的可能：檢測得越多，越能看到腫瘤突變負荷的全貌。
但是，TMB在檢測過程中也會受到一些因素的影響，包括檢測樣本生物學特征，檢測前標本的建立、測序的技術(shù)路線、生信分析、預期用途等。中國食品藥品檢定研究院曲守方研究員指出，生物學方面包括樣本的類型、腫瘤的類型等；分析前包括樣本的固定方法等；測序方面包括DNA捕獲區(qū)域、panel大小、富集方法等；生信分析包括突變類型、胚系突變的過濾等；閾值設定主要包括樣本的類型、腫瘤類型、使用方法等。每個環(huán)節(jié)都非常重要，需要有標準化操作流程，才能保證結(jié)果的準確性。
裕策生物創(chuàng)始人兼CEO高志博博士認為，TMB在臨床指導意義上和適應證有很大的相關性，到底選擇哪一個適應證，前期的探索非常重要。裕策生物基于國產(chǎn)測序平臺，開發(fā)了自己的芯片，同時開發(fā)了相應的TMB的檢測算法，在眾多的樣本里去評價，和WES的檢測結(jié)果高度一致，同時也獲得了TMB檢測的發(fā)明專利。
問題6：如何看待原發(fā)灶不明癌潛在治療靶點的臨床研究路徑？
原發(fā)灶不明癌（Cancers of Unknown Primary，以下簡稱CUP）是一種相對常見的臨床疾病，占所有浸潤性癌的4%-5%。該類腫瘤生物學表現(xiàn)各異，異質(zhì)性較強。這一特征令傳統(tǒng)的檢測方法往往存在局限性，同時也給臨床研究的設計和解讀帶來了不小的困難。杭州市腫瘤醫(yī)院丁紀元教授表示，越來越普遍的高通量測序技術(shù)對部分CUP患者的檢出率得到了提升，但目前暫時缺乏大規(guī)模前瞻性、隨機對照性臨床試驗的證據(jù)支持。圣庭生物谷紅倉教授指出，基因表達譜測序、甲基化檢測等高通量測序技術(shù)對于鑒別腫瘤組織起源具有較好的性能，為實現(xiàn)CUP的精準診療帶來了希望。浙江大學附屬第一醫(yī)院樊龍江教授利用大型腫瘤基因表達數(shù)據(jù)庫，開發(fā)了一種用于分析腫瘤組織起源的生物信息學工具——TOD-CUP算法，對腫瘤原發(fā)部位判斷準確率高達96.0%。“利用高通量測序技術(shù)和生信分析算法對CUP展開大規(guī)模臨床研究，開發(fā)CUP腫瘤溯源基因檢測產(chǎn)品，有助于臨床醫(yī)生制定針對性的治療方案。”首都醫(yī)科大學附屬北京朝陽醫(yī)院病理科主任夏成青總結(jié)道，“隨著生物技術(shù)在醫(yī)學領域的快速發(fā)展和人們在細胞分子水平對腫瘤發(fā)病機制認識的深入，腫瘤診療已經(jīng)進入了全新的基因組時代?！?/span>高通量測序技術(shù)和國產(chǎn)測序平臺的發(fā)展，為癌癥早期檢測診斷以及將精準醫(yī)學引入臨床實踐鋪平了道路。在這個過程中，既需要好的技術(shù)標準和行業(yè)規(guī)范，也需要類似CSCO學術(shù)年會和高通量測序技術(shù)腫瘤專題研討會這類活動帶來的廣泛的行業(yè)討論，從而對這個行業(yè)的長期良性發(fā)展產(chǎn)生深遠的意義和影響。
